На сегодняшний день в КГМА работают 58 кафедр, среди них кафедра физвоспитания занимает ведущие места по итогам учебного года.

В   КГМА им. И.К.Ахунбаева работают спортивные секции по 17 видам спорта, таким как: баскетбол, волейбол, н/теннис, плавание, вольная борьба, греко-римская борьба, самбо, национальная борьба «Курёш», дзюдо, тяжёлая атлетика, лёгкая атлетика, футбол, «ордо», «тогуз-коргоол», шахматы, танцевальный фитнес. Со сборными командами занимаются высококвалифицированные тренера.

Ежегодно кафедра проводит межфакультетские соревнования по 6-ти видам спорта: футбол, баскетбол, волейбол, ордо, шахматы и лёгкая атлетика. К этим соревнованиям стали подключаться и группы иностранных студентов.

Сборные команды по видам спорта ежегодно занимают призовые места в Универсиаде ВУЗов Кыргызской Республики и других Республиканских и Международных соревнованиях.

В КГМА для занятий спортом имеется площадка для занятий варкаутом, два открытых футбольных поля, спортивный зал, зал борьбы, тренажёрный зал, открытые волейбольная и баскетбольная площадки (2х1), площадка для игры в бадминтон и баскетбольная площадка. Так же имеются аудитории для занятий шахматами и тогуз-коргоолом. В 4-м корпусе имеется спортивный зал для занятий фитнесом. В морфокорпусе расположены зал борьбы и зал для занятий тяжёлой атлетикой, зал для игры в настольный теннис. В перспективе строительство 100 метровой дорожки, прыжковой ямы, и спортивной площадки 4х1 (футбольное поле, две баскетбольных и одна волейбольная площадки, беговая дорожка).

Для иностранных студентов первого курса имеется кампус «Таш- Дёбё» расположенный в горах в живописном месте, где имеются для занятий физической культурой: площадка для игры в «крекет», площадка для игры в бадминтон, аудитории для занятий шахматами, 2-а спортивных зала настольного тенниса, открытая волейбольная площадка, фитнес зал.

 - Физ.воспитание.

Ведется тренировочный процесс по таким видам как: баскетбол (дев/юноши), волейбол (дев/юноши), л/атлетика (дев/юноши), н/теннис (дев/юноши), шахматы (дев/юноши), тогуз коргоол (дев/юноши), плаванье (дев/юноши), офп (дев/юноши), вольная борьба (дев/юноши), греко-римская  борьба, самбо, дзюдо (дев/юноши), футбол, курош.